O software DivEs - Diversidade de Espécies foi desenvolvido em 2004 na sua versão 1.0, ainda em Visual Basic 6.0, para atender as diversas demandas de alguns pesquisadores, professores que atuavam em projetos de biodiversidade, incluindo seu desenvolvedor o Prof. Dr. William Costa Rodrigues. A medida que o software foi sendo divulgado uma nova versão foi liberada em 2005 e sendo atualizada até 2009.

Devido a dificuldade com disponibilidade de tempo e mesmo recursos financeiros, muitas versões antes da 3.0, foram abandonadas no decorrer do desenvolvimento, até que no final de 2013, iniciou um trabalho para o desenvolvimento desta versão. Assim as motivações para o desenvolvimento são:

1. Incompatibilidade de Versão 2.0 com as novas versões do Windows (7, 8 e 8.1), principalmente 64 bits;
2. Atualização de índices de diversidades e demais, que já deveriam estar nas versões 2.X;
3. Pequeno aporte financeiro (cerca de R$180,00) realizado em 2012 através de doações. Assim tinha um dever moral de desenvolvê-lo;
4. Oferecer uma ferramenta mais atual, ágil e com opções mais amplas; e
5. Contribuir de forma irrefutável para a ciência Brasileira e Mundial.

Portanto (agora em) a partir de 2014 o software recebe(u) a sua nova versão, que conta com uma série de novidades.

A partir de janeiro de 2018 o software passou a integrar os produtos da AntSoft Systems On Demand